小南海水电站是国务院批准的《长江流域综合利用规划》中规划的梯级水电站，1991年启动可行性研究，原规划位于重庆市巴南区鱼洞街道中坝岛（坝址亦涉及大渡口区跳磴镇和江津区珞璜镇交界处）。该电站坝址控制流域面积70.5万平方公里，设计装机容量170万千瓦，年平均发电量约93亿千瓦时，总投资约320亿元，功能定位包括发电、改善航运及带动区域发展，淹没区涉及重庆四个行政区，淹没面积69.9公顷。坝址位于长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区，淹没区覆盖该保护区缓冲区和实验区河段51.98公里，可能阻断白鲟等濒危物种洄游通道。
该项目1998年因资金问题暂停施工。2015年两会期间遭四川省泸州、宜宾两地政府反对，同年4月环保部在《金沙江乌东德水电站环境影响报告书》批复中明确禁止该项目建设。 2015年前期工作全面停滞后，库坝区实施“封库令”导致区域发展受限，后续生态补偿方案未获实施。2019年9月，重庆市与三峡集团成立了小南海水电站工程后续工作协调小组，双方达成共识将联合上报国务院提出不再建设小南海水电站，并计划对相关区域进行生态开发。 2021年地方政府申请解除封库仍未获批。2022年1月，有市人大代表建议尽快重启小南海水电站建设，以推动能源保供、减碳及解决封库遗留问题。
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