新疆维吾尔自治区地方税务局是新疆维吾尔自治区人民政府主管地方税收工作的职能部门，成立于1994年7月1日，负责全区13个税种的征收管理，包括营业税、企业所得税、个人所得税等，管辖范围覆盖新疆166万平方公里。2018年6月15日，根据国家机构改革部署，该局与原新疆维吾尔自治区国家税务局合并组建国家税务总局新疆维吾尔自治区税务局，承担全区税收、社会保险费和非税收入征管职责。
该局成立时为全国税务系统中最早分设地方税务机构的省（区）之一，全系统下设19个地州市局、22个直属派出机构、86个县（市、区）局及294个基层税务所，共有干部职工7000余人，其中少数民族职工占比30%。合并后领导班子成员包括党委委员、总会计师曹新川等。
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