《纳米核心第二季》（抉择篇）是由张涵执导，上海欣雨动画设计有限公司（海岸线动画工作室）制作的中国大陆科幻冒险3D动画 ，于2016年4月8日在乐视全网独播，共20集 。故事以架空星球元星为背景，围绕瑞一行人经历联合军基地与变种人部落的接连覆灭展开。在精英阶层推进的N.S.P.计划遭受重大挫折、紫雾危机爆发的背景下，主角瑞挣脱人类兵器进化方向的命运枷锁，通过成长过程中的关键抉择，逐渐改变元星被战争阴云笼罩的未来。
该季新增GA-18轰炸、耶梦加得毁灭部落等核心冲突，揭示巴德尔消失后的新阴谋。动画配音阵容包括冯骏骅、谢添天、醋醋等声优，片头曲《Glimmer》由祈inory演唱，片尾曲《Reborn》由ATF组合演绎 。
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