第二军医大学出版社是1997年经国家新闻出版署批准成立的中央级医学科技专业出版社，由解放军总后勤部主管、第二军医大学主办，位于上海市翔殷路800号 。下设编辑部、发行部等多个部门，出版范围涵盖医学教材、学术专著、科普读物等，重点书系包括《21世纪高等医学院校教材应试辅导丛书》 。依托高校学科资源，累计出版图书700余种，年均出书约100种，多部作品获中国人民解放军图书奖、全国高校出版社优秀畅销书奖 。
该社2000年后逐步建立以市场为导向的出版策略，强化专业图书品牌建设 。同时承担《第二军医大学学报》编辑工作，并设立医学编辑硕士研究生培养点 。其出版物被纳入省级图书馆采购体系，并作为医学领域核心出版机构，与人民卫生出版社等并列 。
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