广州海洋馆运营管理有限公司成立于2022年1月26日，注册地位于广州市越秀区先烈中路120号广州动物园内临近北门区域，法定代表人为陈道峻。该公司注册资本5000万元人民币，由广州花园运营管理有限公司（国有全资）100%控股，属广州城投集团旗下企业。 经营范畴涵盖园区管理服务、水族馆管理服务、餐饮服务、住宿服务、动物诊疗、国家重点保护水生野生动物人工繁育及经营等业务领域。
2023年，广州城投集团启动海洋馆升级改造工程，总投资26260.81万元，项目于2024年2月竣工。 2024年6月，提质更新后的广州海洋馆重新开放，8月通过竞拍引进26头海洋生物，涉及瓶鼻海豚、白鲸等物种。 2025年，公司开展夜场灯光工程、洄游馆珠江水域展缸建设等多项招投标项目。
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