植物病理是研究植物病害的发生发展规律及防控技术的学科，属于植物保护领域。该学科起源于金陵大学植物病理学系，1952年全国高校院系调整后成立南京农学院植物病理教研组；1981年成为我国首批博士学位授权点，1989年被确定为国家重点学科，是国家“211”和“985”工程重点建设学科，2007年所属的一级学科植物保护学成为国家一级重点学科 。
主要研究方向包括病原真菌学、分子植物病毒学、植物线虫学、病原与寄主互作机制及病害流行规律等。其研究内容涵盖病害诊断、病原鉴定、流行预测和综合防治，应用于减少作物病害损失，如防控小麦叶锈病、马铃薯晚疫病等 。近期研究揭示了小麦条锈菌通过破坏寄主蛋白的液-液相分离过程实现免疫逃逸的分子机制 ，以及疫霉菌致病的分子机制，相关成果被写入教科书并荣获2025年度教育部自然科学和工程技术特等奖 。在植物线虫学领域，针对马铃薯腐烂茎线虫病的综合防控技术入选2026年农业主推技术，并破译了其首个染色体水平的基因组。学科主办的英文期刊《Phytopathology Research》于2022年获得首个影响因子3.955，位列植物科学Q1区 。
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