东三省总督是清朝于光绪三十三年（1907年）设立的九位最高级封疆大臣之一，负责统辖奉天、吉林、黑龙江三省军政外交事务，其地位位列九大封疆大臣之首 。该职取代了康熙元年（1662年）建立的盛京将军体制，总督府为东北最高军政机构 。清初东北实行八旗驻防与州县民政并行的旗民并治体制，盛京将军主掌军政，奉天府尹管理民政 。因日俄势力渗透与行政矛盾激化，清廷于1907年裁撤三将军，改设行省制，首任总督徐世昌推行整编军队、修筑铁路等新政 。1909-1911年锡良任内抗击东北肺鼠疫，裁撤奉天巡抚实现事权统一。末任总督赵尔巽改革行政机构，设立财政总局等新机构，推动军府制向行省体制转型 。该职存续至1912年清朝灭亡 。
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